Sterowanie zrealizowane zostało za pomocą myszki - to właśnie za jej pomocą wskazywać będziemy miejsce, do którego udać się ma bohaterka oraz przedmioty/osoby, z którymi ma wejść w interakcję. Tutaj warto wspomnieć, że wszystkie przedmioty, które trafią do ekwipunku Sylvie, możliwe będą do użycia w kolejnych etapach gry. Ważnym elementem mają być łamigłówki, za pomocą których odkrywać będziemy kolejne poszlaki i powoli będziemy tworzyć z nich spójną całość. Po rozwiązaniu trudniejszych zagadek będziemy mieli okazję obejrzeć przerywnik filmowy.
Do tej gry dołączona jest gratis gra przygodowa "Wyspa tajemnic".
Agent federalny Teddy Daniels zostaje wysłany na wyspę Shutter, do szpitala Ashecliffe w którym przetrzymywani są groźni przestępcy z zaburzeniami psychicznymi. Musi wyjaśnić tajemnicę zniknięcia Rachel Solando, jednej z pacjentek szpitala. Jeśli jeszcze znajduje się ona na wyspie, nie można dopuścić by się z niej wydostała. W miarę postępów śledztwa Daniels odkrywa jednak, że pochwycenie zbiega może paradoksalnie okazać się najłatwiejszym z zadań, z którymi przyjdzie mu się zmierzyć na Shutter Island.
